молекулярное моделирование

ВИБРОННЫЕ СПЕКТРЫ И СТРУКТУРА ВОЗБУЖДЁННЫХ СОСТОЯНИЙ МНОГОАТОМНЫХ МОЛЕКУЛ

Авторы: Тен Г. Н., Баранов В. И.
Рассмотрены методы определения параметров молекулярных моделей в возбуждённых электронных состояниях. Построены структурно-динамические модели многоатомных молекул полуэмпирическим методом гибридных атомных орбиталей. Показана возможность идентификации по электронно-колебательным спектрам таутомерных форм в разных фазовых состояниях, а также с учетом межмолекулярного взаимодействия.

Колебательные спектры 2-бифенилметанола и их интерпретация на основе моделирования молекулы методом теории функционала плотности с учетом механического ангармонизма

Авторы: Бабков Л. М., Успенский К. Е., Давыдова Н. А.

В приближении гибридного функционала плотности B3LYP/6-31G(d) произведен расчет геометрии, электрооптических пара- метров, квартичного силового поля и колебательных спектров молекулы 2-бифенилметанола. Проведен колебательный анализ и дана полная интерпретация его спектров ИК поглощения (400-3800 см^(-1)) и комбинационного рассеяния (50-3600 см^(-1)).

ИК спектр метил-β-D-глюкопиранозида и его интерпретация на основе построения структурно-динамической модели молекулы

Авторы: Бабков Л. М., Королевич М. В., Моисейкина Е. А.

Методом функционала плотности (B3LYP) в базисах 6-31 G(d), 6-31+G (d, p) построены структурно-динамические модели молекулы метил-β-D-глюкопиранозида: минимизированы энергии, рассчитаны структуры, дипольные моменты, поляризуемости, частоты нормальных колебаний в гармоническом приближении и распределение интенсивности в ИК спектре молекулы, Дана интерпретация ИК спектра метил-β-D-глюкопиранозида, измеренного в диапазоне 400-3700 см^(-1) при комнатной температуре.

Влияние водородной связи на структуру и ИК спектр трифенилфосфита

Авторы: Бабков Л. М., Давыдова Н. А., Ивлиева-Перетокина И. В.

Исследовано влияние водородной связи на структуру и ИК спектр трифенилфосфита. Работа продолжила проведенные ранее исследования влияния конформационных изменений молекулы на его ИК спектр. Измерены ИК спектры образцов в кристаллическом (моноклинная и гексагональная фазы), «глассиал», аморфном и жидком состояниях при температурах 12 и 320 К. Проведено моделирование Н-комплекса молекулы, представленного димером, методом теории функционала плотности B3LYP/6-31G(d).

Расчет структуры и ИК спектра молекулы 2,3-ди-о-нитро-метил-β-d-глюкопиранозида методом функционала плотности

Авторы: Бабков Л. М., Ивлиева И. В., Королевич М. В.

Методом функционала плотности (B3LYP) в базисе 6-31G(d) построена структурно-динамическая модель молекулы 2,3-ди-О-нитро-метил-β-D-глюкопиранозида. Минимизирована энергия, рассчитаны структуры, дипольный момент, поляризуемость, частоты нормальных колебаний в гармоническом приближении и распределение интенсивности в ИК спектре молекулы. Дана интерпретация ИК спектра 2,3-ди-О-нитро-метил-β-D-глюкопиранозида, измеренного в диапазоне 600–3700 см-1 при комнатной температуре.

Межмолекулярное взаимодействие в двухкомпонентных смесях наноалмазов и доксорубицина

Авторы: Бокарев А. Н., Пластун И. Л.

На основе молекулярного моделирования по методу теории функционала плотности с функционалом B3LYP и базисным набором 6-31G(d) исследуется возможность адресной доставки и удержания высокотоксичных лекарственных препаратов в клетках за счёт образования водородных связей между ними и обогащёнными наноалмазами. На приме- ре доксорубицина и карбоксилированных наноалмазов было проанализировано влияние образующихся водородных связей на ИК-спектры и структуру молекулярного комплекса.

ИК спектры трифенилфосфита и их интерпретация на основе молекулярного моделирования

Авторы: Бабков Л. М., Давыдова Н. А., Ивлиева И. В.

Измерены ИК спектры трифенилфосфита в жидкой фазе при температуре 320 К, стеклофазе, состоянии «глассиал», гексаго- нальной (метастабильной) и моноклинной (стабильной) кристаллических фазах – при 12 К. Обнаруженные отличия в спектрах есть следствие реализации в образце конформеров разных типов. Для обоснования этой гипотезы построены структурнодинамические модели трёх наиболее вероятных конформеров (I–III), различающихся углами поворота фенильных колец вокруг связей С-О.

Влияние водородной связи на ИК-спектры и структуру молекулярного комплекса алмазоподобных наночастиц и азотистых оснований ДНК

Авторы: Бокарев А. Н., Пластун И. Л., Агандеева К. Е.

На основе молекулярного моделирования методом теории функционала плотности проанализировано влияние водород- ных связей на ИК-спектры и структуру молекулярного комплекса, образующегося при взаимодействии комплементарной пары азотистых оснований ДНК и алмазоподобных наночастиц. В качестве примера рассматривается взаимовлияние комплементарной пары аденин-тимин и адамантана, окружённого карбоксильными группами. Актуальность подобного исследования обусловливается тем, что в настоящее время алмазоподобные наночастицы находят всё большее применение в различных сферах науки и техники.

ИК спектры циклогексанола и структурно-динамическая модель молекулы

Авторы: Бабков Л. М., Давыдова Н. А., Моисейкина Е. А.

В диапазоне 600–3600 см–1 в широком интервале температур, в различных фазовых состояниях (пластическая фаза I, кристаллические фазы II и III) измерены ИК спектры циклогексанола.

Влияние водородной связи на структуру и колебательный спектр 2,3-ди-о-нитро-метил-β-D-глюкопиранозида

Авторы: Бабков Л. М., Ивлиева И. В., Королевич М. В.

Исследовано влияние водородной связи на строение и ИК спектр 2,3-ди-О-нитро-метил-β-D-глюкопиранозида. Методом функционала плотности (B3LYP) в базисе 6-31G(d) минимизированы энергии, оптимизированы структуры, вычислены дипольные моменты, механические и электрооптические параметры молекулы и ее простейших Н-комплексов – с этиловым спиртом и димеров. Рассчитаны частоты нормальных колебаний в гармоническом приближении и распределение интенсивности в ИК спектрах Н-комплексов с этиловым спиртом.

Страницы